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1 Guerra y error. En: Error y conocimiento, la gestión de la ignorancia. pp. 179 – 205. Editorial Comares, 2012.
2 Reflections for a Taxonomy of Indeterminisms in the Science of Physics. Peruvian Journal of Epistemology. 2012.
3 Javier Ordoñez; Natalia Pérez Galdós. El mundo y la química, un mundo fascinante para nuestros sentidos. Lundwerg, 2011.
4 Javier Ordóñez Ed.; Natalia Pérez Galdós. Trad. El químico escéptico, Robelt Boyle. Crítica, 2012.  ISBN: 9788498923285
5 Conmemoración del cuarto centenario del libro Sidereus Nuncius.Revista de Humanidades.9 – 2,pp. 218 – 225. 2010.
6 Dolores Martín; Javier Ordóñez Rodríguez. «The nursing vocation as political participation for women during the Spanish Civil War». Journal of War and Culture Studies.2 – 3,pp. 305 – 319. Intellect,2009.
7 Javier Ordoñez Rodríguez; Ana Rioja.“The distance as philosophical problem”. (Editor: José Luis González Recio). Philosophical Essays on Physics and Biology. Georg Olms Verlag AG, Hildesheim-Zürich/New York, Germany,2009.ISBN 978-3-487-13713-1
8 Javier Ordóñez Rodríguez. 900-1900 Inventos de un milenio. Lunwerg, 2008. S.L., 2008. ISBN 978-8-497-85750-5
9 Javier Ordóñez Rodríguez; Julio Rubio. Ciencia, tecnología y sociedad en México. Editorial Digital del Tecnológico de Monterrey, 2008. ISBN 978-970-819-094-7
1o  Javier Ordóñez Rodríguez.«Ingenieros, utopía y progreso en la novela española del Ochocientos».Técnica e Ingeniería en España. El Ochocientos, Pensamientos, profesiones y sociedad. (Editor: Manuel Silva Suárez).4,pp. 467 – 514.Aragon(Spain): Real Academia de Ingenieria,2007. ISBN 978-7820-920-0
12 Javier Ordóñez Rodríguez. «Utopía y distopía tecnológica en el XIX español». Utopías, quimeras y desencantos. (Utopía y cultura en la España liberal). Cantabria (Spain): Unican,2007.ISBN 978-84-8102-482-1
13 Javier Ordóñez Rodríguez; Felipe Ramírez. «Los públicos de la ciencia española: un estudio del NO-DO». Cien años de política científica en España. Community of Madrid (Spain): Fundación BBVA, 2007. ISBN 978-84-96515-62-8
14 Javier Ordoñez Rodríguez; Víctor Navarro; José Manuel Sánchez Ron. Historia de la ciencia. pp. 15 – 229. Espasa Calpe, 2007. ISBN 978-84-670-2334-3
15 Javier Ordoñez Rodríguez. «Silicio y cultura». El pensamiento científico en la sociedad actual. (Editor: Javier Ordoñez). Ministero de Eucación y Ciencia. Secretaria General de Educación. Edita: Secretaría General Técnica, 2006. ISBN 84-369-4360-0
16 Ana Rioja; Javier Ordoñez Rodríguez. Teorías del universo: de Newton a Hubble. Vol 3, Editorial Síntesis, 2006.ISBN 978-4-975-6425-0
17 Javier Ordoñez Rodríguez; Ana Rioja.Edición crítica de la exposición del sistema del mundo de Pierre-Simon Laplace, con introducción y notas de los editores. pp. 9 – 80. Crítica,2006.
18 Javier Ordoñez Rodríguez. Prólogo al libro de Carlos López Beltrán. La ciencia como cultura. pp. 9 – 19. Paidós, 2005.
19 Javier Ordoñéz Rodríguez. «De Rocinante a Clavileño». La ciencia y el Quijote. pp. 249 – 257.Crítica/FCEYT ,2005.ISBN 978-84-8432-649-6
20 Javier Ordoñez Rodríguez.“Sobre si se puede hablar de una educación científica humanística”.Ciencia, tecnología y educación. pp. 41 – 60.Iberdrola,2004.
21 Javier Ordoñez Rodríguez.«El señor Kant se hace mayor». Ars Médica. Revista de Humanidades.3 – 2,pp. 288 – 295.Grupo Ars XXI de Comunicación, S.L.,2004.
22 Javier Ordoñez Rodríguez. «Guerra y Distancia». Guerra y Paz en nombre de la política. Concha Roldán, Txetxu Ausin , Reyes Mate (Eds).pp. 293 – 308. Calamar Ediciones, 2004.ISBN 978-84-96235-04-5
23 Javier Ordoñez Rodríguez. «Imagen pública de la ciencia y problemas linguüistico en el periodismo científico». Ciencia, tecnología y lengua española: la terminología científica en español. Reyes Sequera (Coord.).pp. 200 – 208.FECYT,2004.
24 Javier Ordoñez Rodríguez.«Guerra». El laberinto de la violencia. José Sanmartín (Coord.). pp. 175 -192. Ariel,2004. ISBN 978-84-344-7475-8
25 Javier Ordoñez Rodríguez.“Sobre la no neutralidad de los instrumentos científicos”. La física y las ciencias de la vida en el siglo XX: radiactividad y biología. (María José Santesmases y Ana Romero de Pablos).pp. 13 – 22. Universidad Autónoma de Madrid, 2003. ISBN 978-84-7477-885-4
26 Javier Ordoñez Rodríguez.«Los inventores de caminos». Ars Médica. Revista de Humanidades.2 – 2,pp. 289 – 295. Grupo Ars XXI de Comunicación, S.L.,2003.
27 Javier Ordoñez Rodríguez. Ciencia, tecnología e historia. Fondo de Cultura Económica de España, S.L.,2003. ISBN 978-84-3750-535-0
28 Javier Ordoñez Rodríguez.El romanticismo como programa científico». Ciencia y Romanticismo. José Montesinos, Javier Ordóñez y Sergio Toledo (Eds).pp. 81 – 104.Fundación Canaria Orotava de Historia de la Ciencia,2002.ISBN 84-607-8175-5
29 Javier Ordoñez Rodríguez.“Explicación científica y complejidad”. Diversidad de la explicación científica. Wenceslao J. González (Coord.).pp. 52 – 72.Ariel,2002.ISBN 84-344-8763-2
30 José Ferreirós; Javier Ordoñez Rodríguez.Hacia una filosofía de la experimentación. Crítica. 34 – 102,pp. 47 – 86. Universidad Nacional Autónoma de México: Instituto de Investigaciones Filosóficas,2002.ISSN 0011-1503
31 José Manuel Ferreirós Domínguez; Javier Ordoñez Rodríguez. Theoria experimentorum (Número monográfico).Theoria.17 – 44,pp. 209 – 331. Universidad del País Vasco: Centro de Análisis, Lógica e Informática Jurídica, 2002.
32 Javier Ordoñez Rodríguez.El valor de las matemáticas para la ciencia moderna. El valor de las matemáticas. Antonio J. Durán Guardeño y José Ferreirós Dominguez (Coord.).pp. 1 – 10.Universidad de Sevilla, 2001. ISBN 84-472-0568-1
33 Javier Ordoñez Rodríguez.«Violencia y Guerra». Revista de Humanidades: Tecnológico de Monterrey. 11,pp. 77 -92. Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey,2001.ISSN 1405-4167
34 Javier Ordoñez Rodríguez. “Sociedad Industrial y pensamiento positivista”. La filosofía del siglo XX.  José Luis Villacañas (Ed.). 23,pp. 401 – 422.Trotta,2001. ISBN 978-84-8164-473-9
35 Alberto Elena; Javier Ordoñez Rodríguez. «Science, Technology, and the spanish colonial experience in the nineteenth century”. Osiris: Nature and Empire. Science and the Colonial Enterprise. Roy MacLeod (Ed.).15,pp. 70 – 82.University of Chicago Press,2000.ISBN 978-02-2650-078-2
36 Ana Rioja; Javier Ordoñez Rodríguez.Teorías del Universo: de Galileo a Newton (Vol. 2). Síntesis,1999. ISBN 978-84-7738-629-2
37 Ana Rioja; Javier Ordoñez Rodríguez. Teorías del Universo: de los Pitagóricos a Galileo (Vol.1). Síntesis,1999.ISBN 978-84-7738-628-5
38 Alberto Elena; Javier Ordoñez Rodríguez; Mariano Colubi. Después de Newton: ciencia y sociedad durante la primera revolución industrial. Antrophos,1998. ISBN 84-7658-527-6
39 Javier Ordoñez Rodríguez. “La magia de la lente maravillosa: mirar para ver o mirar para imaginar”. La Construcción de la Ciencia: Abstracción y Visualización. María Sol de Mora y Francisco J. Fernández (Eds.).pp. 9 – 31. Universidad del País Vasco,1998.ISBN 84-8964-884-0
40 Javier Ordoñez Rodríguez; José M. Sánchez Ron. “Nuclear Energy in Spain: From Hiroshima to the Sixties». National Military Establishments and the Advancement of Science and Technology. Paul Forman y José M. Sánchez Ron (Eds.).pp. 185 – 213.Kluwer Academic Publishers,1996.ISBN 0-7923-3541-4
41 Javier Ordoñez Rodríguez.“The Story of a Non-Discovery: Helmholtz and the Conservation of Energy”. Spanish Studies in the Philosophy of Science. Gonzalo Munévar (Ed.).pp. 1 – 18.Kluwer Academic Publishers,1996.ISBN 0-7923-4147-3
42 Javier Ordoñez Rodríguez.“De la Revolución Científica a la Revolución Industrial: La dimensión tecnológica del newtonianismo”.  Hispania.LVI/2 – 193,pp. 541 – 564.Consejo Superior de Investigaciones Científicas,1996.
43 Javier Ordoñez Rodríguez; Alberto Elena. «Técnica y poder en la España del siglo XIX: La aventura colonial». Técnica e imperialismo. María Luisa Ortega, Alberto Elena, Javier Ordoñez (Eds.).pp. 49 – 72.Ediciones Turfán,1993. ISBN 84-886-5601-7
44 Javier Ordoñez Rodríguez.«Los mecanismos de innovación: la invención y los sistemas de patentes». Arbor.CXLII – 558,pp. 253 – 270. Consejo Superior de Investigaciones Científicas,1992. ISSN 0210-1963
45 Alberto Elena; Javier Ordoñez Rodríguez.“History of Science in Spain: A preliminary survey”. British Journal for the History of Science.23 – 2,pp. 187 – 196.Editorial Board,1990.
46 Javier Ordoñez Rodríguez; Alberto Elena. La ciencia y su público: perspectivas históricas. Javier Ordoñez y Alberto Elena (Eds.).Consejo Superior de Investigaciones Científicas,1990.ISBN 84-00-07056-9
47 Alberto Elena; Javier Ordoñez Rodríguez. Historia de la Ciencia: De la Antigüedad al Siglo XV (Vol. 1). Universidad Autónoma de Madrid, 1988. ISBN 84-7477-142-0
48 Alberto Elena; Javier Ordoñez Rodríguez. Historia de la Ciencia: De la Revolución Científica a la Revolución Industrial (Vol. 2). Universidad Autónoma de Madrid,1988. ISBN 84-7477-143-9
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